从苏州回到镇江的这几天，周士相一直不得闲，不但有大堆的公文需要他处置，还得不断召见部下将领，对他们面授机宜。原本定于四月北上辽东的计划因江南暴乱不得不暂时搁置下来，当前乱后重建和赈灾等事项成了军部的头等大事。
这其中不但需要军队稳定地方，剿灭余匪，恢复地方治安，重建地方统治，更重要的是，军队需要以“救世主”的面貌面对百姓。原先从各地调集到松江、崇明的大批军粮现在也不得不从仓库拉出，用以赈济因为暴乱而家园被毁的百姓。
初步统计，此次暴乱死伤百姓多达十二万人，流离失所，无家可归的有近五十万众。如果能将赈灾安置和镇反运动相结合，使流离失所的百姓能够尽快返乡重建家园，无疑能够极大改变太平军的形象，拉近太平军和江南百姓的距离。
周士相对灾后重建很重视，相继投入四个镇的力量用于赈灾。在太平军之前，明朝军队几乎还从没有过大规模赈灾的经历，也没有这方面的经验。而早在广东时，太平军就从事过风灾救援和灾后重建的相关工作。一定程度上，太平军已经有了后世人民军队的雏形，当然，仅仅是军队机制的雏形，而不是思想和人性方面。本质上，太平军依旧是一支封建军队，只不过因为统帅的缘故，使之具有了后世军队的一些职能。
在忙着部署灾后重建和灾民安置时，周士相抽出空接见了从北京来的传教士南怀仁。
南怀仁从北京南下后，先是在扬州呆了半个月，然后被送到南都。在去镇江之前，南怀仁见过被定武帝接入宫中的朱慈煊。
朱慈煊出生时即受洗成为天主教徒，教名“当丁”，即“君士坦丁”。当时替朱慈煊受洗的西方教士希望借由朱慈煊的受洗与即位，使明朝能如同罗马帝国般开始转天主教为国教。这一策略很成功，因为不但朱慈煊受洗成了天主教徒，永历帝朱由榔本人也成了天主教徒。
不过可惜的是，朱由榔没能恢复明朝，反而死在了四川的丛山峻岭之中。而明朝现在的皇帝对天主教并不感兴趣，而因为朱由榔的缘故，朱慈煊已然失去了大明帝国继承者的身份。据宫中的消息说，朱慈煊很有可能会被皇帝册封为亲王，然后回到他祖父曾经就藩的衡州居住。这个消息是真是假，南怀仁暂时无从分辨。他可以肯定的是，朱慈煊不可能再成为天主教的合作者，天主教现在唯一能够合作的伙伴就是那位并不在南都的齐王，也就是鞑靼人口中的“贼秀才”。<-->>
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