太平军解决三江口清军后，即传檄广州府所辖各县，至九月底，实际控制香山、增城、番禺、顺德、东莞、三水、新宁、清远等县，另有南海、佛山、新安、连山州等县或被迫反正，或主动反正。
广州府辖十五县一散州只龙门和丛化两县据城自守，不愿归降太平军。龙门叫尚可远所领平南藩下汉军攻破，丛化则叫南雄副将孙义部并太平军一部攻破。二部破城时对城中百姓多有杀戮，言称有辫者即为刁民，逮之便杀，造成二县万余百姓丧命。
消息传至广州，周士相立即发下严令，称日后凡破府县，不论有辫是否无辫，都不得滥杀。有辫者为难民，无辫者为顺民，除非该城守军对太平军造成重大伤亡，否则不得屠城。
为严明军纪，以正太平军大明王师之名，周士相下令斩攻破龙门军百户，原任平南藩下协领一员；总旗二人，原任平南藩下佐领两员，以为惩戒。同时派员接管丛化与龙门县务，调香山县永乐乡长宋达明、龙眼乡长万长隆为二县知县。另令广州府立即调运钱粮安置二县难民，接济百姓，建乡设村，以为长久之计。
反正诸县，只名义上属广州府管辖，南海、佛山、新安、连山州四州县仍旧由原先清廷委任的知县管事，这几县的营兵也不过是换上明军的红色军服而矣，除此之外，一切并无改动。
南海千户王兆兴、佛山千户赵自强，新安千户林兴国、连山州千户吴安远都是绿营将领，王兆兴与赵自强是主动率兵反正，林兴国和吴安远则是见势不妙被迫反正。四人虽授太平军千户职，但其部属营兵仍为其私兵，县中事务也由原清廷委任的知县负责，对于广州只是名义上服从，县内钱粮并不上缴，甚至境内军民都不曾割辫，明显是在明清双方摇摆。若太平军败，则四县再次易帜也是转瞬之间的事。
对此，周士相不予理会，叫广州府不必对四县有何摊派，也不必派人到四县，叫四县就这么保持现状。之所以如此，却是心有余而力不足。收复广州不过月余，周士相既要整合降兵，又要在实际控制的几县进行土地整并，还要派兵剿匪，安置难民，恢复生产，一桩桩事情实在是压得他不得一刻喘息，又哪里能顾得上那四个阳奉阴违的县。
这四县保持现状，名义上服从广州，已经是最好的结局了。便是周士相气不过，或是担心有隐患，派兵去剿，短时间内还是得让四县保持现状，甚至连知县官吏都派不出。既然无法实际控制这四县，又何必派兵去打-->>
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